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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建

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產品特點：	Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建適用于以下細胞類型的文庫制備：癌癥研究：循環(huán)腫瘤細胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細胞或DNA，以及細針抽吸（FNA）細胞；生殖健康研究：胚胎細胞和循環(huán)胎兒細胞；發(fā)育生物學：胚胎細胞，干細胞和稀有細胞；宏基因組學和微生物學：微生物細胞，微生物組和環(huán)境樣品。

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建的詳細資料：

歡迎您致電重慶市華雅干細胞技術有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229

華雅干細胞-客服中心：023-630105781

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建

品牌：Rubicon Genomics

貨號：R300669

規(guī)格：24Rxns

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建

單細胞起始的DNA測序文庫構建

SMARTer^® PicoPLEX^® Gold Single Cell DNA-Seq Kit

· 高重現(xiàn)性和準確性：可用于CNV、SNV和非整倍體檢測
· 在SNV和CNV檢測方面優(yōu)于MDA技術
· 三小時的工作流程，手動操作時間不到30分鐘
· 均勻的高覆蓋率，低的等位基因插入率和脫扣率

應用：

適用于以下細胞類型的文庫制備：

· 癌癥研究：循環(huán)腫瘤細胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細胞或DNA，
以及細針抽吸（FNA）細胞；
· 生殖健康研究：胚胎細胞和循環(huán)胎兒細胞；
· 發(fā)育生物學：胚胎細胞，干細胞和稀有細胞；
· 宏基因組學和微生物學：微生物細胞，微生物組和環(huán)境樣品。

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產品說明：

SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit

SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細胞中生成高質量的DNA文庫，以便在Illumina平臺進行測序的試劑盒。該試劑盒基于PicoPLEX技術，優(yōu)化用于檢測拷貝數(shù)變異 (CNVs)、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結構變異 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測中表現(xiàn)出比MDA技術更好的性能。
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要單獨購買。
PicoPLEX WGA是一種在被廣泛用于檢測單細胞中CNV的全基因組擴增（WGA）技術。初，PicoPLEX技術主要用于高再現(xiàn)性的檢測非整倍體異倍性和CNV。為了滿足準確檢測SNV的需求，對PicoPLEX WGA技術中的酶、引物和protocols進行了進一步優(yōu)化，不僅提升了擴增的覆蓋度、*性、準確性，同時提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重現(xiàn)性。
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細胞或非固定細胞起始，只需簡單的4步操作流程，即可在3小時內完成Illumina NGS文庫的構建，且手動操作時間非常短。

SMARTer DNA HT dual index kits

SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera^® XT v2 index序列對應的index引物，多可提供384種不同的雙端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。其中index引物預先分裝在4個的不同條形碼標記的index微孔板中，每個微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每個孔提供的量足夠進行一次測序反應；另一種是一套中有24個單獨的反應管，每個反應管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664），且每個反應管（24N）提供的量足夠進行兩次測序反應。

SMARTer DNA unique dual index kits

SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對應的index引物，多可提供96種不同雙端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。index引物預先分裝在不同的4組各24個單獨的管中，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）。每個index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進行兩次測序反應。

SMARTer DNA single index kits

SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對應的index引物，可提供24種單端index，用于樣本混合測序時的區(qū)分。index引物預先分裝在不同的2組各12個單獨的管中，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）。每個index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進行8次測序反應。

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圖1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術。
PicoPLEX Gold的技術概要。通過step1裂解細胞獲得gDNA，通過隨機引物進行預擴增 (step 2)，然后進行指數(shù)擴增得到測序文庫（step 4）。

圖2. PicoPLEX Gold的主要特點：高覆蓋度，高均勻性，和高重現(xiàn)性 (與A產品技術相比)。
Panel A. 圖中顯示在不同深度的測序中覆蓋的堿基數(shù) (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產品 (MDA) 相似，在較高深度的覆蓋度高于A產品（MDA）。
Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細胞樣本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A產品進行全基因組擴增。相比較于MDA，PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度。
Panel C. 評估覆蓋度的重現(xiàn)性。與A產品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在兩個單細胞群之間的*性明顯更好。

圖3. 使用PicoPLEX Gold進行高質量單核苷酸變異（SNV）檢測。
Panel A. 以單細胞（1c），5個細胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始，比較A產品（MDA），PicoPLEX Gold（PP Gold）和SMARTer PicoPLEX WGA（PP WGA）這3個試劑盒之間的SNV檢測率。其中1個和5個細胞的測序深度為35M read pairs， gDNA樣品深度為40M read pairs。PicoPLEX Gold（藍色）有高的保真度和覆蓋度，與A產品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比，可以高質量的檢測更多的SNV（2-9倍），具有明顯的優(yōu)勢。
Panel B. PicoPLEX Gold（藍色）的B等位基因頻率的對稱分布，以0.5為中心，展示兩個等位基因的平衡情況。與A產品（MDA）相比，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）。
Panel C. PicoPLEX Gold的無偏擴增, 在測試的所有單細胞文庫制備的技術中，表現(xiàn)出低的等位基因脫扣率（假陰性）。
Panel D. PicoPLEX Gold試劑盒中的聚合酶具有高保真度（藍色），使得等位基因插入率與A產品（灰色）相當，且顯著低于PicoPLEX WGA（紫色）。

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Rubicon擁有ThruPLEX®和PicoPLEX®技術。特殊的引物或接頭設計，能以微量DNA樣本起始構建下一代測序文庫。

ThruPLEX DNA-seq Kit

更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平臺

更高的通量–多達 96 個 index

微量起始樣品（50 pg – 50 ng），更高性能

快速簡單的實驗方法：一根管或孔中，僅三步反應，約 2 小時時間，無需轉移

適用于所有主要的靶向富集平臺–安捷倫 SureSelect® Enrichment，羅氏 NimbleGen® SeqCap EZ®，IDT xGEN® LockDown® probes

ThruPLEX Plasma-seq Kit

專為血漿游離DNA設計

專為cfDNA設計：修復及連接試劑配方更新，方法優(yōu)化

高品質NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內，可以達到高檢測再現(xiàn)性

起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速簡便：單管、2小時、3步操作步驟，無需純化或樣品轉移步驟

應用領域：液體活檢、ctDNA、靶向測序等領域文庫構建

兼容自動化平臺：Beckman® FXP Workstation

Takara&Clontech NGS系列產品

品牌/生產廠家	產品編號	產品名稱	單位
Rubicon Genomics	R300381	PicoPLEX DNA-seq Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R30050	PicoPLEX WGA Kit	50Rxns
Rubicon Genomics	R300644	PicoPLEX WGA Kit	500Rxns
Rubicon Genomics	R300669	SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit	24Rxns
Rubicon Genomics	R300670	SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit	96Rxns
Rubicon Genomics	R300698	SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit	384Rxns
Rubicon Genomics	R300671	SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit	24Rxns
Rubicon Genomics	R300672	SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit	96Rxns
Rubicon Genomics	R300673	SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit	480Rxns
Rubicon Genomics	R400406	ThruPLEX DNA-seq 48D Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R400407	ThruPLEX DNA-seq 96D Kit	96Rxns
Rubicon Genomics	R400427	ThruPLEX DNA-seq 48S Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R400428	ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R400490	ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit	12Rxns
Rubicon Genomics	R400491	ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R400492	ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit	96Rxns
Rubicon Genomics	R400523	ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit	12Rxns
Rubicon Genomics	R400584	ThruPLEX Tag-seq 6S（12）Kit	12Rxns
Rubicon Genomics	R400585	ThruPLEX Tag-seq 48S Kit	48Rxns
Rubicon Genomics	R400586	ThruPLEX Tag-seq 96D Kit	96Rxns