Illumina測序文庫構(gòu)建 |
ThruPLEX® DNA-seq Kit |
· 高靈敏度、高性能:以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料 · 完整的文庫構(gòu)建試劑:優(yōu)化的檢索引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無核酸酶水 · 快速簡便的工作流程:單管或單孔3步操作,2小時,無需轉(zhuǎn)移操作 · 兼容主流目標區(qū)域富集平臺:Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ 及 IDT xGen® Lockdown® probes |
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■ 產(chǎn)品說明: |
ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技術(shù),可以低至50 pg的DNA起始構(gòu)建DNA文庫,在提高靈敏度的同時可以構(gòu)建多達96種檢索引物文庫。本試劑適用于多種樣品來源的片段化DNA樣品,基因組DNA或體液樣品如游離DNA,F(xiàn)FPE樣品來源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整體流程可以在單管或單孔中進行,約2個小時即可完成,無需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟。試劑盒提供12、48或96種Illumina單端或雙端檢索引物,該系列引物保存在反應(yīng)管中(6或12)或預(yù)分裝密封于條形碼標記的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq,RNA-seq,ChIP-seq,并且可以兼容主流平臺實現(xiàn)強有力的目標區(qū)域富集。 |
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圖1. ThruPLEX DNA-seq Kit單管操作流程。 |
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圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA起始(0.05 ng至50 ng)只需3步反應(yīng),簡單高效。 |
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圖3. ThruPLEX DNA-seq Kit 優(yōu)于其他NGS文庫制備試劑。與其他試劑相比,ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA,構(gòu)建多樣性更好(左圖),重復(fù)更少(右圖)的文庫(25 M read pairs)。NGS文庫分別采用圖示對照gDNA起始量,以相應(yīng)的文庫制備試劑制備,采用MiSeq v3 flow cell測序。 *數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc. |
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圖4. ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類基因組相對覆蓋度為GC含量(%)的函數(shù)(50 ng DNA起始)。(左圖)ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個范圍內(nèi)都有出色的覆蓋。(右圖)ThruPLEX DNA-seq Kit (金色)與參試的其他試劑一樣好或更好。請注意,在這些圖中的覆蓋度應(yīng)該為1。人類基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。 *數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc. |
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圖5. ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量更低、范圍更廣。與其他試劑相比,ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量靈敏度是其他試劑的20倍,起始量范圍從50 pg至50 ng,無需流程或接頭濃度優(yōu)化,并且包含檢索引物和接頭。 |
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圖6. ThruPLEX DNA-seq Kit工作流程優(yōu)勢:2小時即可獲得高質(zhì)量NGS文庫。ThruPLEX DNA-seq Kit將雙鏈DNA制備成檢索引物文庫只需3步:末端修復(fù),接頭連接,及高保真文庫擴增。 簡化的工作流程,在單管或單孔中2個小時即可完成,避免樣品損失及操作誤差。 |
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■ 產(chǎn)品組成 |
· Template Preparation Buffer(Red) · Template Preparation Enzyme(Red) · Library Synthesis Buffer(Yellow) · Library Synthesis Enzyme(Yellow) · Library Amplification Buffer(Green) · Library Amplification Enzyme(Green) · Nuclease-Free Water(Clear) · Indexing Reagent(Blue)or Indexing Plate |